Insights on the evolution of the tribe Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia): Ancient DNA from the extinct Pliomys lenki
Plain Language Abstract
The evolution and the relationships between the species of Arvicolinae (known as lemmings, voles, and muskrats) is partially unresolved, being a recurrent topic in the scientific literature. Among the voles, Dinaromys bogdanovi, also known as the Balkan snow vole, is one of the species with unresolved relationship and evolution. Because of the morphology of its molars the Balkan snow vole has been compared and related to the extinct vole Pliomys by most paleontologists, which last known representative, Pliomys lenki, persisted until the Upper Pleistocene. Although both genera, Dinaromys and Pliomys, have been morphologically related, there has always been discussion about when these genera should have separated. In this paper, we use ancient DNA data from Pliomys lenki to demonstrate the relationship between Dinaromys and Pliomys, forming the tribe Pliomyini. Additionally, we propose an evolutionary model of the Pliomyini, placing the separation between the genera Dinaromys and Pliomys around 3.8 Ma (2.6–4.9 Ma), during the Pliocene.
Arabic
رؤى حول تطور قبيلة بليوميني ) قوارض الأرفيكولينات): الحمض النووي القديم من بليوميس لينكي المنقرض
المؤلفون: ماريا بيلار ألفارو إيبانيز، وخايمي ليرا جاريدو، وغلوريا كوينكا بيسكوس، وجوان بونس، وبيري بوفر،
الملخص: يعتبر تطور قوارض الأرفيكولينات موضوعا متكررا للمناقشة في الابحاث العلمية. ويعتبر نوع ديناروميس بوغدانوفي (Dinaromys bogdanovi) احد الأنواع التي ما ذال موقعها التطوري غير معروف. وقد قارن علماء الحفريات بين أضراس هذا النوع مع احافير نوع بليوميس المنقرض ، بليوميس لينكي ((Pliomys lenki ، وهو احدث أحفورة تم تسجيلها أواخر العصر الجليدي. وعلى الرغم من أن كلا الجنسين مرتبطان مورفولوجيا الا ان السؤال متى كان من المفترض أن ينفصل هذان النوعات موضوعل للمناقشة. في هذ البحث استخدمت بيانات الحمض النووي القديمة من احفورة بليوميس لينكي لإثبات العلاقة التطورية بين النوعين وتم اقتراح نموذج تطوري لقبيلة بليوميني والذي يتوقع انفصال النوعين Dinaromys/Pliomys عند حوالي 3.8 مليون سنة (2.6-4.9 مليون سنة).
الكلمات الرئيسية: الحمض النووي القديم؛ قوارض الأرفيكولينات ؛ جينوم الميتوكوندريا؛ التطور البيولوجي
ترجمة: د./ أحمد عوض عبد الهادي (كلية العلوم - جامعة المنيا)
Translator: Ahmed Awad Abdelhady
Chinese
In progress
Translator: Chenyang Cai. Nanjing Institute of Geology and Palaeontology, Chinese Academy of Sciences
Deutsche Zusammenfassung
Einblicke in die Evolution des Stammes der Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia): alte DNA von dem ausgestorbenen Pliomys lenki
Die teilweise ungeklärte Phylogenie der Unterfamilie Arvicolinae ist immer wieder Gegenstand wissenschaftlicher Diskussionen. Unter den Arten, die zu dieser Unterfamilie gehören, ist Dinaromys bogdanovi eine der Arten mit einer unklaren phylogenetischen Position. Paläontologen haben seine Backenzähne traditionell mit denen des ausgestorbenen Pliomys verglichen und in Beziehung gesetzt, dessen geologisch jüngster fossiler Vertreter, Pliomys lenki, bis ins späte Pleistozän überlebte. Obwohl beide Gattungen morphologisch miteinander verwandt waren, gab es immer wieder Diskussionen darüber, wann sich diese Gattungen getrennt haben sollten. In dieser Arbeit verwenden wir alte DNA-Daten von Pliomys lenki, um die phylogenetische Verwandtschaft zwischen Dinaromys und Pliomys aufzuzeigen, die den Stamm Pliomyini bilden. Darüber hinaus schlagen wir ein evolutionäres Modell des Stammes Pliomyini vor, das die Trennung von Dinaromys und Pliomys um 3,8 Ma (2,6-4,9 Ma) ansetzt.
Schlüsselwörter: Alte DNA; Pliomys; Arvicolinae; mitochondriales Genom; Phylogenie
Translator: Eva Gebauer
Resumen en Español
Rodentia): ADN antiguo del extinto Pliomys lenki
La filogenia parcialmente no resuelta de la subfamilia Arvicolinae ha sido un tema recurrente de discusión en la literatura científica. Entre las especies incluidas en esta subfamilia, Dinaromys bogdanovi es una de las cuales cuya posición filogenética permanece sin resolver. En paleontología, tradicionalmente se han comparado y relacionado sus molares con los del género extinto Pliomys, cuyo representante fósil geológicamente más reciente, Pliomys lenki, sobrevivió hasta el Pleistoceno final. Aunque ambos géneros han sido morfológicamente relacionados, siempre ha habido discusión sobre el momento de su separación filogenética. En este artículo, utilizamos datos de ADN antiguo de Pliomys lenki para demostrar la relación filogenética entre Dinaromys y Pliomys, formando la tribu Pliomyini. Además, proponemos un modelo evolutivo de la tribu Pliomyini, situando la separación Dinaromys/Pliomys hace aproximadamente 3,8 Ma (2,6–4,9 Ma).
Palabras clave: ADN antiguo; Pliomys; Arvicolinae; genoma mitocondrial; filogenia
Traducción: Authors
Résumé en Français
In progress
Translator: Denis Audo. Centre de Recherche en Paléontologie - Sorbonne Université or Vincent Perrier, Université Lyon.
Vincent Perrier, Maître de Conférences Université Lyon 1
Greek
Πληροφορίες για την εξέλιξη της φυλής Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia): Αρχαίο DNA από το εξαφανισμένο Pliomys lenki
Η εν μέρει ανεπίλυτη φυλογένεση της υποοικογένειας Arvicolinae είναι ένα επαναλαμβανόμενο θέμα συζήτησης σε επιστημονικές εργασίες. Μεταξύ των ειδών που ανήκουν σε αυτή την υποοικογένεια, το Dinaromys bogdanovi είναι ένα από τα είδη με ασαφή φυλογενετική θέση. Οι παλαιοντολόγοι παραδοσιακά συνέκριναν και συσχέτισαν τους γομφίους του με το εξαφανισμένο Pliomys, του οποίου ο γεωλογικά νεότερος εκπρόσωπος στο απολιθωμένο αρχείο, το Pliomys lenki, παρέμεινε μέχρι το Ύστερο Πλειστόκαινο. Αν και και τα δύο γένη έχουν συνδεθεί μορφολογικά, πάντα γινόταν συζήτηση για το πότε έπρεπε να διαχωριστούν. Σε αυτό το άρθρο, χρησιμοποιούμε αρχαία δεδομένα DNA από το Pliomys lenki για να δείξουμε τη φυλογενετική σχέση μεταξύ Dinaromys και Pliomys, σχηματίζοντας τη φυλή Pliomyini. Επιπλέον, προτείνουμε ένα εξελικτικό μοντέλο της φυλής Pliomyini, τοποθετώντας τον διαχωρισμό Dinaromys/Pliomys γύρω στα 3,8 Ma (2,6–4,9 Ma).
Keywords: Αρχαίο DNA, Pliomys; Arvicolinae; μιτοχονδριακό γονιδίωμα, φυλογένεση.
Translator: Evangelos Vlachos
Polski
Spostrzeżenia na temat ewolucji plemienia Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia):
Starożytne DNA wymarłego Pliomys lenki
Częściowo nierozwiązana filogeneza podrodziny Arvicolinae jet powracającym tematem dyskusji w pracach naukowych. Spośród gatunków należących do tej podrodziny Dinaromys bogdanovi jest jednym z gatunków o niejasnej pozycji filogenetycznej. Paleontolodzy tradycyjnie porównywali i odnosili jego zęby trzonowe do wymarłego rodzaju Pliomys, którego geologicznie najmłodszy przedstawiciel kopalny, Pliomys lenki, przetrwał do późnego plejstocenu. Chociaż oba rodzaje były morfologicznie spokrewnione, zawsze toczyła się dyskusja na temat tego, kiedy te rodzaje oddzieliły się od siebie. W tym artykule wykorzystujemy dane z badań kopalnego DNA Pliomys lenki, aby wykazać filogenetyczne powiązania między Dinaromys i Pliomys, tworząc plemię Pliomyini. Ponadto proponujemy ewolucyjny model plemienia Pliomyini, umieszczając separację Dinaromys/Pliomys około 3,8 Ma (2,6–4,9 Ma).
Słowa kluczowe: Kopalne DNA; Pliomys; Arvicolinae; genom mitochondrialny; filogeneza
Translator: Krzysztof Stefaniak
Russian
Представление об эволюции трибы Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia): древняя ДНК вымершего Pliomys lenki
Частично неразрешенная филогения подсемейства Arvicolinae была и остается неизменной темой дискуссий в научных статьях. Среди таксонов, принадлежащих к этому подсемейству, Dinaromys bogdanovi является одним из видов с неясным филогенетическим положением. Палеонтологи традиционно сравнивают и связывают его коренные зубы с таковыми у вымершего рода Pliomys, среди которого геологически самый молодой ископаемый представитель, Pliomys lenki, сохранялся до позднего плейстоцена. Несмотря на то, что эти роды были морфологически родственными, всегда шла дискуссия о том, когда они должны были разделиться. В этой статье мы используем образцы древней ДНК Pliomys lenki, чтобы продемонстрировать филогенетическую связь между Dinaromys и Pliomys, образующими трибу Pliomyini. Мы предлагаем эволюционную модель трибы Pliomyini, в рамках которой расхождение Dinaromys и Pliomys произошло примерно 3,8 млн лет назад (2,6–4,9 млн лет назад).
Ключевые слова: ископаемая ДНК; Pliomys; Arvicolinae; митохондриальный геном; филогения
Translator: Leonid Voyta
Ukrainian
Уявлення про еволюцію триби Pliomyini (Arvicolinae, Rodentia): древня ДНК вимерлого Pliomys lenki
Частково невирішена філогенія підродини Arvicolinae була і залишається постійною темою обговорень у наукових статтях. Серед таксонів, які належать до цієї підродини, Dinaromys bogdanovi є одним із видів із неясним філогенетичним положенням. Палеонтологи традиційно порівнюють і пов’язують його корінні зуби з такими у вимерлого роду Pliomys, геологічно наймолодший викопний представник якого, Pliomys lenki, зберігався до пізнього плейстоцену. Незважаючи на те, що ці роди були морфологічно спорідненими, завжди точилася дискусія про те, коли вони повинні були розділитися. У цій статті ми використовуємо зразки древньої ДНК Pliomys lenki, щоб продемонструвати філогенетичний зв’язок між Dinaromys і Pliomys, які утворюють трибу Pliomyini. Ми пропонуємо еволюційну модель триби Pliomyini, у рамках якої розходження Dinaromys і Pliomys відбулося приблизно 3,8 млн. років тому (2,6–4,9 млн. років тому).
Ключові слова: древня ДНК; Pliomys; Arvicolinae; мітохондріальний геном; філогенія.
Translator: Oleksandr Kovalchuk