PALEOVIEW3D: FROM SPECIMEN TO ONLINE DIGITAL MODEL
Nicholas E. Smith and Suzanne G. Strait
The ability to create 3D models of fossils has revolutionized
the way paleontologists examine specimens. As technology advances, Computed
Tomography (CT) or "Cat" scanners and 3D laser scanners have proven efficient
systems for generating these models and further permit the development of online
3D databases. These online "museums" also afford the ability to easily and
quickly disseminate paleontological specimens via the Internet. One such
database, PaleoView3D (www.paleoview3d.org), is an online collection of models
of late Paleocene and early Eocene (approximately 55 million years ago) fossil
mammals. This website is designed not only for the visualization of specimens,
but also to allow researchers to download 3D models for their own research.
Before these models can be incorporated with certainty, however, it is necessary
that researchers understand how the models were created, and know how much they
deviate from the original specimens. The goal of this study was to standardize,
automate, and document a new laser scanning/modeling process used to generate
specimens for the PaleoView3D database. To ensure that the models
published in the database accurately represent the original specimens, we
conducted an extensive error study on the system using control objects of known
dimensions (i.e., a small screw and a certified scale bar). Since many of the
specimens are casts of originals (or even casts of casts), we also conducted a
casting error study, to examine how much variation was exhibited by multiple
casting generations. We found the entire modeling process to be highly accurate,
and by developing a platform holding up to nine individual specimens and
creating a software macro incorporating many operations into a single click, we
greatly improved the efficiency of modeling. By standardizing and documenting
the modeling process used for PaleoView3D, as well as assessing the accuracy,
researchers can now determine whether or not these models are appropriate for
their particular studies. We also recommend that current and future online 3D
databases adopt similar policies, to help promote the distribution of compatible
3D data in paleontology.
PaleoView3D: desde el espécimen al Modelo
Digital “Online”
Nicholas E. Smith y Suzanne G. Strait
Los recientes
avances en la adquisición de datos en 3D, y la habilidad para digitalizar las
colecciones de los museos han revolucionado la forma en la que se puede acceder
y visualizar los especimenes paleontológicos. Instrumentos como los escáneres CT
de alta resolución y los escáneres láser 3D han simplificado el proceso de
digitalización, pavimentando el camino para los museos online 3D.
Los objetivos
de este estudio fueron dobles. Primero, automatizar, estandarizar y documentar
las técnicas láser de escaneado/modelado usadas para generar modelos para una
base de datos, PaleoView3D. Segundo, usando PaleoView3D como caso de estudio,
ilustrar la necesidad para otros sitios web de incluir estudios de error
detallados, protocolos de modelado y metadatos asociados para facilitar el uso
comparativo de datos morfológicos online.
La
automatización y estandarización se lograron mediante la tinción de los
especimenes con clorito de amonio, desarrollando con ello una plataforma
multiescáner de 9 especímenes, e implementando una macro con tiempo combinado de
modelado reducido en un 60%. Se desarrolló un extenso estudio del error para
comprobar la precisión de esta técnica usando controles de dimensiones conocidas.
El proceso resultó muy preciso en las 3 dimensiones, con porcentaje de error de
: 1D = 0,4%; 2D = 0,05%; 3D = 1,74%. Debido a que muchos de los especimenes
digitalizados eran moldes, se desarrolló también un estudio del error moldeado/replicado.
La primera y segunda generación de moldes (p.e.: un molde de un molde) se
desviaban del espécimen original un máximo de ± 0.074 mm y, como se esperaba, la
variación se incrementaba ligeramente en cada nueva generación. Estandarizando y
documentando la metodología y precisión de esta técnica, los investigadores
puedan tomar una decisión informada sobre cómo usar modelos de PaleoView3D.
PALABRAS CLAVE: escáner láser;
modelos 3D; Paleoview3D.org; mamíferos fósiles; Paleoceno; Eoceno
Translator: Manuel Salesa
PaleoView3D: du spécimen au
modèle digital en ligne
Nicholas E. Smith et Suzanne G. Strait
Les avancées technologiques récentes
dans le domaine de l’acquisition de données 3D et la capacité à digitaliser les
collections de musées ont révolutionné les possibilités d’accès et de
visualisation des spécimens paléontologiques. Des instruments comme les scanners
tomographiques haute-résolution et les scanners laser 3D ont simplifié le
processus de digitalisation, ouvrant la voie aux musées 3D en ligne. L’objectif
de cette étude est double. Tout d’abord, il est d’automatiser, de standardiser,
et de documenter la technique de scannage/modélisation laser utilisée pour
générer des modèles pour une telle base de données, PaleoView3D. Dans un
deuxième temps, en utilisant PaleoView 3D comme étude de cas, il est d’illustrer
la nécessité pour d’autres sites internet d’inclure les études d’erreurs
détaillées, les protocoles de modélisation, et les meta-données associées pour
faciliter l’utilisation comparative de données morphologiques mises en ligne.
L’automatisation et la standardisation
ont été obtenues en enduisant les spécimens avec du chlorure d’ammonium, en
construisant une plateforme multiscan de 9 spécimens, et en implémentant une
macro d’auto-surfaçage qui réduit le temps de modélisation de 60%. Une
importante étude d’erreurs a été réalisée pour tester la précision de cette
technique en utilisant les contrôles de dimensions connues. Le processus est
très précis dans les trois dimensions avec des pourcentages d’erreurs de 1D =
0.4%; 2D = 0.05%; 3D = 1.74%. Une étude d’erreur sur le moulage a été réalisée
car de nombreux spécimens digitalisés étaient des moulages. Les moulages de
première et deuxième génération (i.e., « moulage de moulage ») dévient des
spécimens d’origine d’un maximum de ± 0.074 mm et comme attendu, la variabilité
grandit légèrement avec les générations suivantes. En standardisant et
documentant la méthodologie et la précision de cette technique, les chercheurs
peuvent prendre une décision motivée concernant l’utilisation des modèles de
PaleoView3D.
Mots-clefs : scannage laser ; modèles 3D ;
PaleoView3D.org ; mammifères fossiles ; Paléocène ; Eocène
Translator: Loïc Costeur
PaleoView3D: vom Stück zum
digitalen Model im Internet
Nicholas E. Smith und Suzanne G. Strait
Neue technologische Fortschritte in der
dreidimensionalen Datenerfassung und die Fähigkeit, Museums Sammlungen zu
digitalisieren, haben die Art und Weise der Visualisierung und Verfügbarkeit von
paläontologischen Stücken revolutioniert. Geräte wie hochauflösende CT-Scanner
und 3D Laserscanner haben den Digitalisierungs-Vorgang vereinfacht, und den Weg
für 3D Museen im Internet freigemacht. Diese Untersuchung hatte zwei Ziele.
Erstens die Techniken des Laserscans und der Modellierung, die zum Erstellen
einer Vorlage einer solchen Datenbanken benutzt wurden, zu automatisieren,
standardisieren und zu dokumentieren. Zweitens wurde PalaeoView3D als Testfall
benutzt, um die Notwendigkeit dar zu stellen, daß andere Webseiten detaillierte
Fehler-Studien, Modell-Protokolle und dazugehörigen Metadaten berücksichtigen
müssen, um die Vergleichsmöglichkeiten von Online morphologischen Daten zu
vereinfachen.
Automatisierung und Standarisierung
wurden durch das Überziehen der Stücke mit Ammonium-Chlorid, der Erstellung
einer Multiscan-Plattform mit neun Stücken und der Einführung eines Makros zur
automatischen Oberflächendarstellung erreicht, was zusammen die
Modellierungszeit um 60% reduzierte. Eine ausführliche Fehlerstudie wurde
durchgeführt, um die Genauigkeit dieser Technik zu testen, wobei Kontroll-Stücke
mit bekannten Dimensionen benutzt wurden. Der Vorgang war in allen drei
Dimensionen sehr genau, mit prozentualen Fehlern von: 1D = 0.4%; 2D = 0.05%; 3D
= 1.74%. Da viele der digitalisierten Stücke Abgüsse waren, wurde auch eine
Form/Guß Fehlerstudie durchgeführt. Abgüsse in erster und zweiter Generation (d.
h. Abguß eine Abgusses) wichen vom Original mit einem Maximum von ± 0.074mm ab,
und die Abweichung erhöhte sich in den darauffolgenden Generationen, wie zu
erwarten, etwas. Basierend auf dieser Standarisierung und Dokumentation der
Methode und Genauigkeit dieser Technik können Wissenschaftler fundierte
Entscheidungen treffen, wie PaleoView3D Modelle einzusetzen sind.
SCHLÜSSELWÖRTER: Laser scanning; 3D
Modelle; Paleoview3D.org; fossile Säugetiere; Paläozän; Eozän
Translator: Franziska
Großmann
Translator: Iyad S. Zalmout, University of Michigan
Museum of Paleontology, USA and Mohamed S.M. Antar, Wadi Al-Hitan,
Egypt.
PaleoView3D: OD OKAZU DO DOSTĘPNEGO W SIECI
CYFROWEGO MODELU
Nicholas E. Smith &
Suzanne G. Strait
Ostatnie postępy w dziedzinie zbierania danych 3D i zdolności do
przenoszenia okazów z kolekcji muzealnych do formatów cyfrowych
zrewolucjonizowały sposób w jaki możemy wizualizować i mieć dostęp do okazów
paleontologicznych. Urządzenia takie jak skaner tomografii komputerowej wysokiej
rozdzielczości oraz skaner 3D uprościły proces przenoszenia danych do formatu
cyfrowego, torując drogę do trójwymiarowych muzeów internetowych.
Cele tej pracy były dwojakie. Po pierwsze, zautomatyzowanie,
standaryzowanie i udokumentowanie metodyki laserowego skanowania/modelowania
użytej przy generowaniu modeli dla bazy danych PaleoView3D. Po drugie, użycie
paleoView3D jako testowej bazy danych mającej zilustrować potrzebę włączania
szczegółowych badań błędów, protokołów modelowania oraz stowarzyszonych
metadanych do innych stron internetowych celem ułatwienia porównawczego
wykorzystania dostępnych przez internet danych morfologicznych.
Automatyzacja i standaryzacja zostały osiągnięte przez pokrycie
okazów chlorkiem amonu, zbudowanie platformy do jednoczesnego skanowania
dziewięciu okazów oraz wbudowanie samopoziomującego makro, które zredukowały
czas modelowania o 60%. Rozległe badania błędów zostały przeprowadzone w celu
przetestowania dokładności stosowanej techniki przy użyciu czujników znanych
wymiarów. Proces był wysoce dokładny we wszystkich trzech wymiarach z procentem
błędu: 1D=0,4%; 2D=0,05%; 3D=1,74%. Ponieważ wiele z okazów, które zostały
przeniesione do formatu cyfrowego było odlewami, badanie błędów podczas robienia
form i odlewania zostało również przeprowadzone. Odlewy pierwszej i drugiej
generacji („odlewy odlewów”) różniły się od oryginalnych okazów o ± 0.074mm i,
jak oczekiwano, różnice zwiększały się nieznacznie przy następnych generacjach.
Dzięki standaryzacji i dokumentacji metodologii oraz dokładności tej techniki
badacz może podejmować świadome decyzje dotyczące użytkowania modeli z bazy
PaleoView3D.
SŁOWA KLUCZOWE: skanowanie laserowe, modele
3D, PaleoView3D.org, wymarłe ssaki, paleocen, eocen
Translators:
Dawid Mazurek and Robert
Bronowicz
|